Конец эпохи «двойных льгот»: запрет на совмещение статуса ИТ-компании и Сколково с 2026 года

С 1 января 2026 года для технологического бизнеса закрылась возможность совмещать два льготных режима одновременно — статус аккредитованной ИТ-компании и участника проекта «Сколково» либо инновационного научно-технологического центра. Компании придется выбрать один налоговый трек. 

Чтобы не пропустить новые материалы «MDS Media», подписывайтесь на наш Телеграм-канал.

Суть законодательных изменений: почему нельзя использовать оба режима одновременно

Поправки внесены в Налоговый кодекс РФ. Раньше компания могла одновременно пользоваться пониженными тарифами страховых взносов как ИТ-организация и специальными условиями, предусмотренными для участников «Сколково» или проектов по закону № 216-ФЗ от 29.07.2017. 

С 1 января 2026 года ИТ-компании — участники «Сколково» или инновационных научно-технологических центров не вправе применять льготные тарифы страховых взносов, предусмотренные для аккредитованных ИТ-компаний. Для них сохраняются специальные тарифы, действующие в рамках соответствующего статуса: 30 процентов с части выплаты в пределах 1,5 МРОТ и 15 процентов с остальной части выплаты, если предельная база по взносам не превышена; либо 15,1 процента в пределах 1,5 МРОТ и 15 процентов с остальной части при превышении базы.

Одновременно для таких компаний действует право на применение ставки 0 процентов по налогу на прибыль либо освобождение от его уплаты на срок до десяти лет при соблюдении установленных условий. Основание — пункт 1.15 статьи 284 НК РФ.

Сотрудники компаний‑резидентов «Сколково» смогут пользоваться льготной ипотекой для IT‑компаний по ставке 6% только до ноября 2027 года.

Сравнительный анализ: условия Сколково vs ИТ-аккредитация

Когда выгоднее остаться резидентом «Сколково»

Режим «Сколково» больше оправдан для стартапов с низкой текущей выручкой и длительным циклом разработки, когда компания сосредоточена на R&D и не планирует быстро выходить на массовый рынок. Нулевая ставка по налогу на прибыль и освобождение от НДС по ряду операций позволяют минимизировать налоговую нагрузку в период создания продукта.

Дополнительным преимуществом остаются льготы по ввозу оборудования и возмещение таможенных пошлин, что критично для проектов, связанных с аппаратными решениями, лабораторной инфраструктурой и научными исследованиями

Преимущества перехода на ИТ-льготы в 2026 году

Для компаний с устойчивой выручкой и значительным фондом оплаты труда переход на ИТ-режим может оказаться экономически более рациональным. Ставка налога на прибыль в размере 5 процентов в 2025–2030 годах дает наиболее предсказуемую налоговую модель, а пониженные страховые взносы в размере 7,6 процента (в рамках лимита) носят бессрочный характер.

Кроме того, для аккредитованных ИТ-компаний действуют специальные гарантии и моратории на отдельные виды проверок, что снижает административную нагрузку и упрощает взаимодействие с контролирующими органами.

Алгоритм действий для ИТ-директора и главного бухгалтера

После запрета на совмещение режимов ключевая задача управленческой команды — заранее просчитать последствия и формально корректно зафиксировать выбор.

Первый этап — оценка структуры выручки по критериям Минцифры. Для сохранения ИТ-аккредитации компания должна соответствовать требованиям к доле профильных доходов от деятельности в сфере разработки, адаптации и сопровождения программного обеспечения и баз данных. Анализ проводится по итогам отчетного периода с учетом договорной базы, классификации услуг и корректности отражения операций в бухгалтерском и налоговом учете. Ошибки в квалификации доходов могут привести к утрате статуса.

Второй этап — расчет налоговой нагрузки в каждом из режимов. Необходимо сопоставить ставку налога на прибыль, тарифы страховых взносов, режим по НДС и косвенные эффекты, включая влияние на инвестиционную привлекательность и распределение дивидендов. Расчет проводится с учетом фонда оплаты труда, динамики выручки и планируемых капитальных затрат. Для быстрорастущих ИТ-компаний пониженные страховые взносы могут дать больший эффект, чем нулевая ставка по налогу на прибыль при невысокой маржинальности.

Третий этап — процедура уведомления налоговых органов и корректировка учетной политики. В зависимости от выбранного режима потребуется либо подтверждение соответствия критериям ИТ-компании, либо продолжение применения специального статуса участника инновационного центра. Бухгалтерская служба должна отразить изменения в учетной политике, скорректировать расчеты авансовых платежей и обеспечить правильное применение тарифов с 1 января 2026 года.

Риски несвоевременного выбора и возможные доначисления

Если компания вовремя не определится с режимом и продолжит применять две льготы одновременно, налоговая пересчитает обязательства. Это означает доначисление страховых взносов или налога на прибыль по общим ставкам, а также пени и штрафы.

Другой риск связан с ИТ-аккредитацией: если после выбора режима компания формально не соответствует критериям Минцифры по структуре выручки, право на льготу могут отменить задним числом с начала года. В таком случае бизнесу придется доплатить разницу за весь период.

Также под удар могут попасть сотрудники. Если компания утратит статус ИТ-аккредитованной, работники могут лишиться права на льготную ипотеку и других преференций.

Юридические советы MDS: как сохранить максимальную поддержку от государства

В условиях ужесточения правил главная стратегия — не искать способы формального совмещения режимов, а выстроить прозрачную и устойчивую модель. Компании стоит заранее провести аудит договоров и бизнес-процессов, привести классификацию услуг в соответствие с требованиями Минцифры, закрепить корректное распределение функций между разработкой, внедрением и сопутствующими сервисами.

Если бизнес работает на стыке R&D и коммерциализации, возможна реструктуризация группы компаний с разделением функций. Однако такие решения требуют аккуратной проработки с учетом налоговых и корпоративных рисков.

Для юристов, которые хотят системно погрузиться в индустрию, создан курс «Юрист в сфере IT». Программа позволяет освоить инструменты цифрового права, понять механику ИТ-аккредитации и научиться работать в связке с продуктовой командой, выявляя юридические риски еще на этапе идеи. Обучение построено на реальных кейсах от практикующих экспертов из МТС, Яндекса, НИУ ВШЭ и Ozon.